Το Κ.Ε.ΚΑ.Π.Ε.Ρ. – Περιφέρειας Κρήτης έχει ως βασική του αποστολή την συμβολή στην:
- Καταπολέμηση της απειλής της ανεργίας η οποία προκαλείται από τις ραγδαίες τεχνολογικές/ βιομηχανικές αλλαγές.
- Προσαρμογή του εργατικού δυναμικού του νομού αλλά και της περιφέρειας σ’ αυτές τις αλλαγές.
- Παροχή επαγγελματικής κατάρτισης ,εξειδικευμένων συμβουλών και μεταφοράς τεχνογνωσίας που οδηγούν στην βελτίωση αλλά και στην εισαγωγή καινοτόμων δεξιοτήτων.
- Τοπική ανάπτυξη με την ορθολογική αξιοποίηση των συγκριτικών πλεονεκτημάτων του νομού.
- Προώθηση καινοτόμων πρωτοβουλιών τόσο στην δια βίου εκπαίδευση και κατάρτιση όσο και σε άλλες δραστηριότητες με Ευρωπαϊκή σπουδαιότητα και επίδραση.
- Ανάπτυξη σχέσεων και συνεργασιών με διάφορους οργανισμούς, αρχές και ειδικούς επιστήμονες που βασίζονται στην ιδέα της ενεργού ανταλλαγής προβληματισμών για την βελτίωση της ποιότητας των κοινωνικών και οικονομικών δυνατοτήτων.
- Προώθηση πρωτοβουλιών για «ΙΣΕΣ ΕΥΚΑΙΡΙΕΣ» στην κατάρτιση και την απασχόληση.
- Καταπολέμηση των αιτιών που οδηγούν σε κοινωνικό και οικονομικό αποκλεισμό από την αγορά εργασίας, ειδικών κοινωνικών ομάδων.